Le microbiote désigne l’ensemble de micro-organismes vivant dans un environnement appelé microbiome. Le microbiote humain comprend des bactéries, virus, champignons ou levures, archées et autres micro-organismes, que l’on retrouve sur ou dans le corps humain.
Sur la peau, on parle de microbiote cutané, qui se nourrit de sébum et de cellules mortes. Dans la bouche, on parle le microbiote bucco-dentaire ; dans les voies respiratoires on parle de microbiote pulmonaire ; au niveau des organes génitaux on parle de microbiote vaginal, avec de nombreux lactobacilles favorisant l’acidité du vagin ; dans le tube digestif on parle de microbiote intestinal encore appelé flore intestinale.
